宋真宗得风湿病后，刘皇后参预朝政，凡事皆问丁谓。丁谓误国，寇凖、王旦、向敏中等元老重臣都上奏建议应选择正大光明的大臣来辅佐太子监国。寇凖还特别指出：“丁谓、钱惟演是奸佞之人，不能辅佐少主。”其实是在反对刘皇后预政，反对丁谓专权。病中的宋真宗也意识到丁谓专权的严重局势，批准了寇凖等人的上奏。寇凖让知制诰杨亿秘密起草太子监国的诏旨，并且准备与杨亿一起辅政。

　　刘皇后是四川人，她娘家的人仗势犯法，宋真宗为了刘皇后的面子，下诏赦免。寇凖坚决反对，认为必须按国法处置。为这件事，刘皇后与寇凖结下怨仇。不料，寇凖与杨亿密谋由太子监国一事被杨亿的妻弟张演酒后泄漏，刘皇后先下手为强，罢寇凖为太子太傅，封为莱国公。正在这个节骨眼上，和丁谓有私怨的太监周怀政联络同党，企图发动政变，斩杀丁谓，复相寇凖，尊宋真宗为太上皇，拥立皇太子即位。这件事被客省使杨崇勋出卖。丁谓连夜化装乘牛车到曹利用那里商量对策。丁谓、曹利用派兵包围了周怀政的住处。周怀政被俘后自杀。丁谓想乘机干脆把寇凖置于死地，就诬告寇凖参与密谋。寇凖虽没被问成死罪，却再次罢相，被逐出京城。

客死雷州
　　寇凖遭贬，据说是丁谓等背着宋真宗干的。据《宋史·寇凖传》记载，寇凖被贬，真宗卧病不知，问左右的人为什么多日没见寇凖，左右臣僚都不敢回答实情。寇凖离开京城那天，大臣们由于害怕丁谓，都不敢去送行，只有王曙以“朋友之义”为寇凖饯行。参知政事李迪十分愤懑，公然宣布自己与丁谓不共戴天，甚至持手板击打丁谓。李迪面奏皇帝痛斥丁谓之奸邪，力诉寇凖之蒙冤。寇凖再次罢相后，丁谓当了宰相，将寇凖一贬再贬。

　　乾兴元年（1022年），含冤负屈离开道州而向南部海滨雷州赴任。到任后，连个像样的住房也没有，但当地官员、百姓素来仰慕寇凖的为人，主动替他盖房，安排寓所。他在任上，除少数政务外，主要是读经释书，闲暇时写字、会友，每逢客至，则笑脸相迎，毫无权贵大官的样子。在雷州时，指导当地居民学习中州音；传授农业技术、兴修水利，开渠引水灌溉良田；向群众解说天文地理，力避邪说；同时还修建真武堂，收徒习文学艺，传播中原文化，对雷州文明发展起到促进作用。