经过薛时雨的整治，杭州逐步恢复了生产和经济，百业兴旺，文人墨客常聚会于西灵隐寺，赏玩景色，吟诗作画。距灵隐寺不远有一座“风月亭”，风光月色令人赏心悦目，亭旁有一块平整的山石。大家提议请文人墨客题字，可请谁呢？人们早知薛时雨文思不凡，便恳请他题字。推辞不过的薛时雨端坐在风月亭中，略加思索便站起来，挥笔写下了两个遒劲的大字“虫”和“二”。写完放下笔，欣然离去。众人不解，猜测议论纷纷，有一位秀才，干脆找到杭州府来，“薛大人，不知您为湖心亭前所书‘虫’和‘二’是何意，请指点指点。” 薛时雨哈哈一笑道：“‘虫’者，是“风”去掉几，意为风无边，‘二’者，是‘月’去掉‘月’，意为月无际，‘虫’和‘二’合起来便是‘风月无边’之意啊。”秀才听了连声赞绝，薛时雨智题湖心亭的传说，很快在人们中流传开来，至今在湖心亭的岛南仍留有这块石碑。
薛时雨杭州任知府三年多，深得百姓爱戴，却受到了同僚的诋毁。恰在这时，任御使的仲兄薛春黎前往江西主考乡试，在试院暴病身亡，巡抚急调薛时雨改任江西乡试提调官。在充任提调官中，薛时雨看透了官场腐败，愤然托病辞归，这年他还不到50岁，浙江巡抚马新贻深知他的学识才干，以二品衔候选道解来挽留他，他却坚辞不授。最后，马新贻提出聘他于杭州主讲“崇文书院”，他答应了。他在杭州主讲崇文书院三年，写下了大量诗词歌赋，评论家秦湘叶评价他的诗词“如西湖山水清而华秀而苍，往往引人入胜，趋向固不外白苏一二家，而伤时感事之作沉郁顿挫且骏骏乎人杜陵之室……”他培育了许多人才，最著名的有张预、冯熙等人。由于他兴办教育做出了成绩，浙江人在杭州西湖凤林寺后为他建造住舍，取名“薛庐”。接着他又到南京主讲江宁“尊经书院”、“惜阴书院”，在这两个书院，他又收了许多学生，不论贫富，不论贵贱，不论老少，只要愿意来学的，他都收下，甚至有个盗贼也来求学，他也收下了。有人指责他“不分尊卑，滥收弟子，竟然收盗贼为徒，书院成猪圈喽!”薛时雨却不以为然，他说：“我培养人才并非是使用人才，培才宜宽，用才宜严。”他还主张经世致用，反对读死书。南京人因其培育出大批人才，在教育上作出杰出贡献，在南京钟山山麓建造“薛庐”以纪念他。
清代：薛时雨
软翠泛迢迢，是绝佳、春江设色图谱。老我卧烟波，沙堤上、常狎睡鸥拳鹭。
拖蓝染黛，无端荡起愁千缕。临流洄溯，伤一舸难归，好春虚度。
当时送客怀人，惯肠断西洲，魂滑南浦，逝水促华年，新来恨、更比别情酸楚。
桃根渺矣，那堪重唤江头渡。可怜弱絮。问甚日成萍，随流飘去。
南浦 陈槐庭大令钟英以碧草绿波制题各赋一阕余适悼沈姬之亡藉以
清代：薛时雨
烟水衬平芜，转眼来、春光茜媚如许。一色染青袍，勾挑起、多少客愁离绪。
王孙去也，萋萋总是伤心处。长亭遮住。疑化血魂归，一灵常聚。
天涯几度登楼，念故国阙河，迷离无路。渺渺逗吟情，何人续、金勒马嘶佳句。
暮云千里，凝眸犹恐看朱误。哀思欲诉。伤玉瘗香埋，墓门深护。
清代：薛时雨
秋人直凭无聊，玉阶踏碎凉蟾影。愁肠百结，醉中难遣，又逢酒醒。
月在青天，风来画阁，露生金井。听蛩吟鹤唳，总关秋思，叵耐得、相如病。
容易名场梦冷。纪前因、雪泥空證。元龙豪气，香山宦迹，樊川游兴。
湖海逢迎，莺花侍从，半生侥倖。想斯人位置，悠悠青史，待何人定。
清代：薛时雨
归去来兮，朝衫脱却，那须带阔冠峨。尘中羁绊，辗转误人多。
争似幕天席地，何处好、何处高歌。歌成了，自酬自唱，私淑老东坡。
如何还艳羡，山中起蛰，泽畔飞梭。任风驱浪捲，井自无波。
问我他年经济，关心在、园卉庭柯。逍遥乐，閒中布置，未雨剪青蓑。
清代：薛时雨
浪拥江声，云浮海气，奔流直下吴淞。巨壑腾蛟，危楼结蜃，遥天万里空濛。
喷薄起鱼龙。念苍茫身世，寄与艨艟。浊酒孤斟，铜弦高唱大江东。
八蛮重译来同。算汉家长策，只是和戎。水驿驰轮，楼船激箭，海门百道能通。
落日大旗红。叹藩篱久撤，谁靖边烽。聊把黄金买醉，歌舞向西风。
清代：薛时雨
板桥风景艳当年。花月斗婵娟。画船省识青溪路，惯停桡、丁字帘前。
十里香尘不断，而今付与颓垣。
莺啼蝶怨晚芳天。何处拾遗钿。杨花飘落浑无主，一团团、乱扑溪烟。
应有白头词客，旧愁弹上新弦。